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2020
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鸡遗传育种创新团队成功解析鸡胸肌组织异质性并发现标记基因
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近日，我所鸡遗传育种创新团队聚焦鸡肌肉和肌内脂肪（IMF）性状研究，通过引入单细胞RNA测序等方法，解析了不同发育阶段鸡胸肌组织异质性，并发现IMF标记基因APOA1（Apolipoprotein A1）和 COL1A1（Type I collagen），为高效优质肉鸡新品种培育提供了理论基础。
据刘冉冉副研究员介绍，鸡肉已成为世界第一大消费肉类，我国肉鸡年出栏量居世界第一位，骨骼肌发育与肉鸡产肉效率和肉品质均密切相关，深入解析肌肉和IMF发育的分子基础，是探明性状形成和调控机理、研发分子选育技术的必要基础。
本研究以团队选育的京星黄鸡IMF上选系为素材，利用单细胞RNA测序和原位RNA杂交等检测方法，对生长发育早期和快速生长两个发育阶段进行了研究。结果表明，生长早期胸肌组织由10个细胞类群构成，其中包含5个成肌细胞群和2个脂肪细胞群，部分细胞群间呈现边界不清的状态；而生长快速期由7个细胞类群构成，细胞呈现明显的分化完全状态。这是首次在单细胞层面解析不同发育阶段鸡胸肌组织的异质性。研究进一步在脂肪细胞上调表达基因中，鉴定出APOA1和COL1A1为肌内脂肪细胞特异性表达基因，并可作为标志基因为肉品质分子调控相关研究提供必要信息。
相关研究成果发表在《BMC基因组（BMC Genomics）》（IF=3.594）上，硕士生李京徽为该论文第一作者，刘冉冉副研究员为通讯作者；IMF标记基因已申请发明专利（201911351311.1）。该研究得到国家自然基金面上项目，肉鸡产业技术体系岗位科学家项目，中国农业科学院科技创新工程项目支持。
原文链接：https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-020-07136-2
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